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前身是成立于1976年的台州地区环保科研监测站(所)，1997年4月经台州市编委批准单独设置.经过多年建设，台州市环科院业已发展成为从事环境科学研究,生态环境规划,环境影响评价,ISO14000体系认证咨询,清洁生产审核,工程咨询,环保产品开发和各种环境污染控制工程设计,安装,调试,运营一条龙服务的综合研究开发单位.该院目前拥有国家注册环评持证上岗人员28人，ISO14001体系认证国家注册审核员6人,内审员3人，OSHMS体系认证国家注册审核员1人，清洁生产国家 审计师8人，ISO9001体系国家注册审核员1人，大学以上学历技术人员占全院职工92%以上，专业齐全，人才荟萃，实力雄厚，现代化办公设施配备齐全，监测仪器和实验设备完善，是浙江省内从事环境科学研究,生态环境规划,环境工程设计,环境影响评价,清洁生产审核,环保设施运营,工程咨询服务等工作的规模较大,专业设置较齐全,技术水平较高的科研单位.我院内设办公室,总工办,科研规划部,工程设计部,环境影响评价中心,认证咨询审核中心六个部门，并实行"一院两制"，拥有全资企业台州市污染防治工程技术中心，并建立了多家紧密合作型的联合企业环保设备制造公司(厂)，并已成为知名大学科教实践基地.